復合肥選用時要注意走出誤區，復合肥比較單質肥有明顯優越性。但在選用時要注意走出如下誤區。 
1、不分作物種類使用。不同農作物對復合肥中的養分形態和比例需求不一樣。但在生產中不分作物種類而盲目使用的情況比較多見。如低含量復合肥用于早稻、油菜等作物則明顯不能滿足這些作物對素的需要，低鉀含量的復合肥則不能滿足玉米、晚稻、紅薯、烤煙、甘蔗等需鉀量較大的農作物需要。特別是含比較多的復合肥在烤煙、茶葉、西瓜等忌作物上使用，引起烤煙燃燒性變差、西瓜變咸不甜、茶葉新葉死亡，嚴重降低農產品品質。因此要根據不同農作物需肥特點來選擇適當的復合肥品種。一般說來，禾谷類作物施肥要以提高產量為主，主要應根據土壤養分豐缺狀況來確定復合肥中養分形態和配比；而經濟作物對氮鉀需求量鉀＞氮，經濟作物增施鉀肥不僅可以提高產量，更重要的是對品質有重要作用。與大多數經濟作物一樣，塊根類作物（如紅薯）、根莖類作物（蓮藕、玉竹等）、玉米、晚稻等宜選用含鉀量比較高的復合肥；相對而言，早稻、花生、芝麻、油菜、辣椒等作物要注意選用含量較高的復合肥；葉類蔬菜宜選用含氮量較高的復合肥。西瓜、草莓、葡萄、柑桔、烤煙、茶葉等忌作物應選用含量低的硫基復合肥。鑒于復合肥養分比例固定，在使用時要配合使用單質肥。以復合肥為主，單質肥用以調節和補充。提倡使用專用復合肥，如水稻專用肥，柑桔專用肥，西瓜專用肥等。 
2、不分土壤類型使用。如含硝態氮復合肥在水田中使用，因淋溶性和反硝化脫氮作用而損失嚴重；含枸溶性肥（如鈣鎂肥）復合肥在石灰性土壤（偏堿性）使用則肥效差。有鑒于此，含硝態氮復合肥應在旱地上使用，而不宜在水田里使用；含離子和銨離子的復合肥不宜在鹽堿地上使用；含硫酸根離子復合肥好不要在水田上使用，含鈣鎂肥復合肥宜在酸性土壤和中性土壤上使用。